Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP4Q6PIL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms