Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO38Q6PIJ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO38Q6PIJ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms