Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE2Q6PIF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms