Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASC4Q6P4E1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms