Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEPROQ6NW34 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms