Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms