Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARA3Q6AZY7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms