Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TXNDC8Q6A555 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TXNDC8Q6A555 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms