Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CLQ60I27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms