Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ECM29Q5VYK3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms