Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF3Q5VWG9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms