Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOCADQ5VW36 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOCADQ5VW36 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms