Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRCH2Q5VUJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms