Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFMBT2Q5VUG0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms