Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms