Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PXDC1Q5TGL8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PXDC1Q5TGL8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms