Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM78Q5T7P6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms