Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH8Q5T0T0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms