Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms