Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KHDC3LQ587J8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms