Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms