Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD39Q53RE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms