Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms