Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms