Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP100Q494V2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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