Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
C17orf58Q2M2W7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C17orf58Q2M2W7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms