Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RTL8BQ17RB0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTL8BQ17RB0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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