Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP6Q16828 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP6Q16828 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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