Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGISQ16647 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGISQ16647 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms