Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SNAPC1Q16533 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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