Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIK4Q16099 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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