Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHRNA2Q15822 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHRNA2Q15822 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms