Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNHIT3Q15649 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNHIT3Q15649 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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