Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYCP1Q15431 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms