Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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