Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ELOBQ15370 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELOBQ15370 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms