Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDGFRLQ15198 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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