Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDK1Q15118 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDK1Q15118 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms