Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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