Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAPTM4AQ15012 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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