Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SSPNQ14714 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSPNQ14714 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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