Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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SEMA3AQ14563 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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