Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG2Q14126 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG2Q14126 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms