Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms