Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC3Q13507 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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