Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN4PQ13434 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN4PQ13434 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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