Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM28Q13263 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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