Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAF1AQ13111 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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