Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH17Q12864 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH17Q12864 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH17Q12864 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH17Q12864 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH17Q12864 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH17Q12864 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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