Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIAQ12857 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFIAQ12857 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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